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Chemical Study/단백질6

단백질 공학 Cell-free display systems for protein engineering (2) Cell - Free Display에는 5가지 방법이 존재한다. 1. Alternantive to phage display and cell surface display systems 2. In vitro compartmentalization 3. Ribosome display 4. mRNA display 5. Covalent and noncovalent DNA display 목차 4. mRNA display Linkage of genotype and phenotype by mRNA Similar with ribosome display 3' end of the mRNA template should be linked to a single stranded DNA bonded to puromycin -> cov.. 2023. 8. 11.
단백질 공학 Cell-free display systems for protein engineering (1) Cell - Free Display에는 5가지 방법이 존재한다. Alternantive to phage display and cell surface display systems In vitro compartmentalization Ribosome display mRNA display Covalent and noncovalent DNA display 5가지 중에서 (1)~ (3)을 정리하고자 한다. 목차 1. In Vitro Proetin Synthesis Reaction 3가지 필수구성요소( Cell extract, Templates, Additives to enhance protein synthesis efficiency)가 존재한다. Extract(추출물) 고려되어야할 사항들 : efficiency .. 2023. 8. 11.
[단백질 공학] Yeast surface display, MACS, FACS 목차 Yeast surface display 효모 세포면에 엔지니어링하고자하는 protein에 target protein을 묶는다. 이 기술은 다음과 같은 단계로 이루어집니다: 효모 세포를 재조합 단백질을 담고 있는 표현 벡터로 변형된다. 변형된 효모 세포를 성장시키면서, 벡터로부터 단백질이 효모 세포의 표면에 노출된다. 노출된 단백질이 특정 화합물에 결합하는지 검사하기 위해, 특정 표적 화합물과 반응하는 단백질을 표현하는 효모 세포의 분리를 수행한다. 분리된 세포는 후속 실험을 위해 재생산된다. scFV, Fab, T cell receptor, MHC molecules, cytokines, enzyme 등에 사용된다. 출아형 효모에서는 Aga1 - Aga2 상호작용에 이용된다. Yeast surface.. 2023. 3. 28.
[단백질 공학] Protein display 공부 - Cell Surface display, Bacterial surface display Cell surface display 특징 a high throughput manner에서 directed evolution을 위한 가장 유용한 도구이다. 다양한 host cell(Gram(+) bacterial, Gram(-) bacterial, yeast, insect cells, baculorias, mammalian cells)에서 사용된다. 세포표면에 display함으로서 유전자형과 표현형을 linkage한다. 기능으로는 desiging, engineering, therapeutic, proteins, vaccines, biosensors, biocatalysts에 사용된다. E.coli Expression system - Well-characterized genetics - Ease of ma.. 2023. 3. 12.
[단백질 공학] 파지 디스플레이(Phage display) 공부 -Phage structure, Hybrid Phage, Phage infection, library Phage Display 개요 가장 잘 알려진 protein binder selection platform이고 실험 방법이 단순하여 널리 사용되고 Stability와 Affinity를 향상시킨 단백질 변이체를 만들기 위한 방법이다. 주로 실험실 환경(In vitro)에서 진행되는 방법으로 variants of proteins(특정 한원에 결합하는 protein)들은 phage particles의 표면에 생성된다. 응용분야에는 Isolation of high affinity binders, slection of highly stable protien variants, protein - protein interaction 분석, long scale protein function stduy 이 있다. 주로 M.. 2023. 3. 12.
[단백질 공학] 항체 공부 - Antibody engineering, Protein display(Phage display, cell surface display) 항체의 구조 항체는 light chains 와 heavy chains으로 이루어져 있다. Fab는 항원을 targeting 하여 항원과 항체가 binding 하도록 하는 역할을 수행한다. Fc는 antibody function을 조절한다. FcγRs(Fc-gamma receptors)는 여러 가지 면역세포에 존재하며, hindge에 binding 되어 있다. CH1, CL과 hindge를 인식한다. 또한, effector functions 기능을 수행한다. FcRn은 항체의 반감기(Serum Half-life)에 관여하고 CH2 와 CH3를 인식한다. 보통 항체의 반감기는 3주 정도인데 Antibody engineering을 통해 FcRn에 변화를 줌에 따라서 항체의 반감기는 달라진다. Types of .. 2023. 3. 12.

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